L'Anna Sasaki és una noia tímida i poc sociable que pateix asma. El metge comenta a la seva mare que li convindria un canvi d'aires, de manera que l'envien al petit poble on viuen els seus oncles, tot esperant que allà millori la seva salut i que l'ajudi a posar en ordre les idees.
L'Anna passa l'estiu amb els oncles i gaudint de la seva passió dibuixant, fins que un dia descobreix una antiga mansió abandonada. Ben aviat s'adona que no està pas abandonada, i hi coneix una noia misteriosa anomenada Marnie. La Marnie aconsegueix que l'Anna acabi obrint el seu cor, però l'Anna acabarà descobrint que la Marnie no és només una nena misteriosa. Quina és la veritat que s'amaga rere la mansió abandonada a l'altre costat de la maresma?
"La Marnie dels meus records" és una emotiva història d'una noia que descobreix l'amistat i que també es descobreix a si mateixa.