La història, basada en el manga d'Adachi del mateix nom, gira al voltant d’un triangle amorós format per la Minatsu Nakazato, una jove estudiant i jugadora de softbo, en Shu Akiba, company d’escola, i en Naoto Kadomatsu, un futur boxador. En realitat, la relació a tres bandes és més aviat a tres i mitja, si tenim en compte que en Naoto està enamorat de la Maria... que en realitat és la mateixa Minatsu, que una vegada s’havia disfressat per a escapar-se d’uns malfactors.

Tsubasa Ozora és un nen amant del Futbol que es trasllada a una nova ciutat. Aquí coneix a Ryo Ishizaki, qui té un enfrontament amb Genzo Wakabayashi, un nen arrogant que, a més de ser un excel·lent porter, assisteix a una escola famosa per ser el planter de futures estrelles del Futbol. Després de presenciar aquest fet, Tsubasa decideix desafiar a Genzo. A partir d'aquí, naixerà una gran rivalitat i després una meravellosa amistat entre aquests nens, que després de caminar junts pel torneig nacional d'escoles, estaran destinats a convertir-se en les futures estrelles del Futbol Japonès.

La màgia no és real, tothom ho sap. Tot i que quan la fa un veritable expert, la màgia té la capacitat de sorprendre i meravellar el públic. En Kaito Kuroba, fill del famós mag escènic Touichi Kuroba, no és aliè a aquest fet. Ben versat en les arts de l’engany, en Kaito trastoca sovint la vida dels qui l’envolten amb trucs i bromes cridaneres. Però quan en Kaito ensopega accidentalment amb un passadís amagat a casa seva, descobreix un secret que podria haver estat ben bé la causa de la mort del seu pare ara fa vuit anys: el vestit blanc d'en Kid, el lladre fantasma. Volent saber més coses del seu pare, en Kaito es posa el vestit i cerca la Gemma de Pandora, que diuen que atorga la immortalitat. Tot i això, no és l’únic que cerca la joia: l’organització responsable de la mort del seu pare també hi va al darrere. "Magic Kaito" segueix el renaixement d'en Kaito Kid, el lladre fantasma de la nit. Utilitzant els seus maniquís, disfresses i la seva característica pistola de cartes, en Kaito es proposa robar les joies més precioses del món, tot descobrint la veritat darrere de la mort del seu pare i la rumorosa Gemma de Pandora al llarg del camí.

En els darrers anys de l'era Bakumatsu va viure un llegendari assassí anomenat Hitokiri Battousai. Temut com a assassí sense pietat, no tenia igual a tot el país, però va desaparèixer misteriosament al punt àlgid de la Revolució japonesa. Han passat deu anys pacífics d'ençà, però la simple menció d'en Battousai continua causant terror al cor dels veterans de guerra. Sense que ells ho sàpiguen, en Battousai ha abandonat el seu estil de vida sanguinari per a mirar de penedir-se dels seus pecats, i ara viu sota el nom de Kenshin Himura, un espadatxí vagabund amb una actitud alegre i una voluntat forta. Amb la voluntat de no tornar a matar, en Kenshin es dedica a protegir els febles. Un dia, topa amb la Kaoru Kamiya al seu dojo de kendo, que està sent amenaçada per un impostor que diu ser en Battousai. Després de rebre ajuda d'en Kenshin, la Kaoru li permet romandre al dojo, de manera que l'exassassí deixa temporalment els seus viatges. La sèrie explica la història d'en Kenshin mentre s'esforça per salvar els qui cal salvar. Tanmateix, a mesura que comencin a aparèixer enemics tant del passat com del present, serà el reformat assassí capaç de defensar els seus nous ideals?

Capítols especials de la sèrie «Owari no Seraph».

Beelzebub tracta sobre el delinqüent juvenil més fort, l'Oga Tatsumi, estudiant de primer any a l'institut Ishiyama, l'escola per a delinqüents. Durant una revenja, l'Oga es troba "casualment" amb el fill del dimoni; com que és el pitjor delinqüent (el més malvat i el més fort), és elegit per a tenir-ne cura. Tot provant de desfer-se del merder que li ha caigut a sobre, comença a cercar per tot l'institut algú pitjor que ell que s'encarregui del nadó, tot derrotant a tot aquell qui es troba al seu pas i destruint l'institut, de passada.

Conjunt d'històries curtes creades pels assistents de Gosho Aoyama, que no pertanyen a l'argument principal de la sèrie.