Fa una dècada, un tràgic naufragi va separar la Fena Houtman del seu amic de la infància, en Yukimaru, i es va prendre la vida del seu pare. Ara, amb 23 anys, està atrapada en una illa i condemnada a passar la resta de la seva vida venent-se als homes. Durant la nit en què s'ha de casar per força amb un client, la Fena trama un pla per a escapar-se dels seus amos, però dos vells coneguts intervenen inesperadament i l'ajuden a fugir. Tots tres s'afanyen cap a mar obert i desembarquen a l'illa Goblin, un lloc misteriós que és la llar d'un clan de guerrers ferotges. És allà on la Fena s'assabenta que el desafortunat viatge final del seu pare era a la recerca d'un lloc anomenat "Edèn", la ubicació d'alguna cosa important que havia de protegir. Amb res més que un cristall com a pista, la Fena s'haurà d'encarregar de trobar aquest lloc, ja que és l'única persona que ho pot fer. Mentre encara recerca el que el seu pare va deixar enrere, la Fena es retroba amb en Yukimaru, que l'anima a continuar l'aventura. Ara capitana d'una tripulació de set persones, la Fena haurà de navegar per alta mar a la recerca de l'Edèn. Però a mesura que grups estranys comencen a atacar-la, el perillós viatge resulta ser encara més difícil del que semblava anteriorment.

Després d'un conflicte militar devastador, els països fan la guerra a l'ombra. Un espia inusual, en Klaus, no ha fracassat mai en la feina malgrat les seves peculiaritats, i està reunint un equip per a dur a terme una missió impossible... amb més del 90% de probabilitat de fracàs. No obstant això, els membres que ha elegit són tots fracassats sense experiència. Hauran d'utilitzar tots els trucs que coneguin (i fins i tot els que no) per a demostrar que estan a l'alçada!

A simple vista, el caça-recompenses amnèsic Wu Liuqi sembla bastant intimidant. Amb les seves tècniques telequinètiques amb les tisores i la capacitat de transformar-se en qualsevol cosa, sorprèn el seu comportament modest. De fet, en Wu fa fatal la seva feina. Sovint es troba anant al darrere de la persona equivocada.

Encara que la seva discreta feina diària com a perruquer i la seva feina fora de l'horari laboral són simplement un mitjà per pagar un deute, els seus dos negocis semblen entrellaçar-se amb la recerca per recuperar el seu passat perdut.

Acceptant reptes, aprenent dels fracassos, superant obstacles i vencent els millors del món, en Satoshi aconsegueix finalment el seu somni. El seu esperit aventurer, però, continua sent-hi, i no deixa d’explorar noves regions, descobrir Pokémon desconeguts i forjar amistats i rivalitats inesperades. A mesura que el món obre els seus amplis horitzons a en Satoshi, ell torna a trobar-se amb les persones que van ajudar a donar forma al seu transcendental camí cap a l’èxit. Un viatge llegendari s’acosta a la seva fi, però un altre de completament nou està a punt de començar, amb l’etern vincle entre els humans i els Pokémon.