Night Raid és la branca d’assassinat encoberta de l’Exèrcit Revolucionari, un moviment que s’ha aixecat per enderrocar el primer ministre Honest, la cobdícia i set de poder del qual l’han portat a aprofitar-se de la inexperiència de l’emperador infant. Sense un líder fort i benevolent, la resta de la nació es veu condemnada a ofegar-se en la pobresa, el conflicte i la ruïna. Tot i que els membres de Night Raid són assassins experimentats, entenen que prendre vides és lluny de ser lloable, i que probablement hauran d’afrontar la seva pròpia retribució mentre eliminen sense pietat qualsevol que s’interposi en el camí de la revolució.

El nou membre d’aquest alegre grup d’assassins és en Tatsumi, un noi ingenu d’un poble remot que havia emprès un viatge per ajudar la seva vila empobrida i que va quedar convençut no només pels ideals de Night Raid, sinó també per la seva determinació. Akame ga Kill! segueix en Tatsumi mentre lluita contra l’Imperi i s’enfronta a armes poderoses, assassins enemics, desafiaments als seus propis valors i morals, i, finalment, al veritable significat de ser un assassí amb una causa.

La Uka Ishimori no té bons records de la secundària. La van anomenar "pedra" a causa del seu nerviosisme quan algú li parlava i va patir assetjament. Ara, a batxillerat, desitja començar de nou i millorar com a persona. Però, durant la seva primera setmana, acaba xopa de llimonada a causa d'en Kai Miura, un company de classe amb uns cabells de color llimona.

En Kai sembla tot el contrari de la Uka. És popular, té amics i no dubta en dir el que pensa. Tot i les seves diferències, en Kai l'anima a canviar i li dona un cop de mà quan ho necessita. I encara que al principi la Uka volia fer-se'n amiga, s'acaba adonant que s'ha enamorat d'ell. El que va començar amb una llimonada, canviarà la vida de la Uka i en Kai per sempre.

Aquesta història té lloc en una ciutat particular amb dues escoles infames en constant disputa: l’Institut Chidori, una escola masculina freqüentada principalment per estudiants de classe baixa amb notes pèssimes, i la seva veïna, l’Institut Femení Kikyo, on la majoria de les alumnes provenen de famílies riques i prestigioses. Un dia, en Rintaro Tsumugi, un estudiant de segon any de batxillerat a Chidori, d’aspecte ferotge però de caràcter amable, està ajudant a la pastisseria familiar quan coneix una clienta anomenada Kaoruko Waguri. En Rintaro gaudeix del temps amb la Kaoruko, ja que ella no el jutja pel seu aspecte, però aquesta pau idíl·lica es veu ràpidament alterada quan en Rintaro descobreix que la Kaoruko és, en realitat, una estudiant de Kikyo. Aquesta revelació marca l’inici de la seva història plena de dificultats, mentre lluiten contra les limitacions imposades per les seves escoles i l’entorn per trobar el seu propi camí!

Recull de diferents one-shots:
1) Okite Saisho ni Suru Koto wa - Shimura Takako
2) Parsley to Mini Tomato - Ukino
3) Yuki iro Machiboke - Mikage Tsubaki
4) Ni-choume no Chiisana Sakana - Hideki Kawai
5) Kosha Ura no Natsu - Sakurabi Hashigo
6) Senaka - Tsuda Yuki
7) Aishi Aenai Koi Naraba - Kiyomizu Hikari
8) Mura wo Deta Kara Kuri - Natsuki Zippo
9) STAKEOUT - Itoi Nozo
10) Love in Motion - Kumota Haruko
11) Yasashii Dakeno - Suzuki Tsuta

Un noi i una noia, als qui els agrada vestir-se amb un estil lolita i un altre punk respectivament, entrecreuen els seus camins. Tots dos viuen vides paral·leles a la feina, on la seva aparença no hi té res a veure.