En els darrers anys de l'era Bakumatsu va viure un llegendari assassí anomenat Hitokiri Battousai. Temut com a assassí sense pietat, no tenia igual a tot el país, però va desaparèixer misteriosament al punt àlgid de la Revolució japonesa. Han passat deu anys pacífics d'ençà, però la simple menció d'en Battousai continua causant terror al cor dels veterans de guerra. Sense que ells ho sàpiguen, en Battousai ha abandonat el seu estil de vida sanguinari per a mirar de penedir-se dels seus pecats, i ara viu sota el nom de Kenshin Himura, un espadatxí vagabund amb una actitud alegre i una voluntat forta. Amb la voluntat de no tornar a matar, en Kenshin es dedica a protegir els febles. Un dia, topa amb la Kaoru Kamiya al seu dojo de kendo, que està sent amenaçada per un impostor que diu ser en Battousai. Després de rebre ajuda d'en Kenshin, la Kaoru li permet romandre al dojo, de manera que l'exassassí deixa temporalment els seus viatges. La sèrie explica la història d'en Kenshin mentre s'esforça per salvar els qui cal salvar. Tanmateix, a mesura que comencin a aparèixer enemics tant del passat com del present, serà el reformat assassí capaç de defensar els seus nous ideals?

L'Aida Shizuka és a tres dies de ser executat per assassinar cruelment a la seva família quan un shinigami (déu de la mort) ve a visitar-lo. És la seva germana petita Hibiki, que ha vingut a assegurar-se que la seva ànima va a l'infern. La Hibiki té una altra missió en aquest viatge: concedir-li un últim desig a una nena que pateix d'una malaltia cardíaca, i arrossega el seu germà condemnat juntament amb ella. Aviat es fa evident que les coses no són tan simples com semblen, i fins i tot la culpabilitat de la Shizuka es posa en dubte. La Hibiki i la Shizuka prometen buscar junts la veritat sobre la mort de la seva família.

En Kuroshi Megumi és un jove que té una maledicció que ha estat a la seva família durant generacions. Una maledicció que els obliga a servir la família Kogami. Però aquesta família té un accident i només en queda una supervivent...

Chizuru Yoshida obté el que desitja dels seus amants masculins amb els seus encants, mostrant-se de vegades freda i manipuladora, però mai ha estat enamorada de ningú...fins que apareix Azumi, una nova alumna que és transferida a la seva mateixa classe. Sense poder acceptar estar enamorada d'altra noia, travessa una breu etapa de còlera i negació plantejant-se proves per a convèncer-se que podria sentir-se atreta per qualsevol, menys per una noia tan simple, tímida i ingènua. A causa de la seva desesperació i que constantment pensa en Azumi, resol finalment tornar-se la seva amiga.