Després de perdre la seva germana fa set anys, la vida d'en Satsuki Kakeru queda completament buida, i només serà capaç de tornar a portar una vida normal amb l'ajuda de la seva amig de la infància, la Yuka Minase, i altres amics de l'escola.
Un dia sobtadament, el cel es torna vermell i la lluna negra. Tothom al voltant d'en Kakeru i la Yuka desapareix, i uns monstres comencen a aparèixer pels carrers. Ells només són capaços de fugir i amagar-se, però després d'un temps, tot torna a la normalitat. Però just quan pensaven que allò havia estat només un somni, la Nit Roja es produeix de nou.