En Koyomi Araragi, un estudiant de tercer any de secundària, aconsegueix sobreviure a un atac de vampirs amb l'ajuda d'en Meme Oshino, un home estrany que resideix en un edifici abandonat. Tot i haver estat salvat del vampirisme i ser actualment un ésser humà, encara se'n mantenen diversos efectes secundaris, com ara les habilitats curatives sobrehumanes i la visió millorada. Sigui com sigui, l'Araragi mira de viure la vida d’un estudiant normal, amb l’ajuda del seu amic i de la presidenta de la classe, la Tsubasa Hanekawa. Quan la seva companya de classe Hitagi Senjougahara cau per les escales i és atrapada per l'Araragi, el noi s'adona que la noia no pesa gens. Malgrat les protestes de la Senjougahara, l'Araragi insisteix a ajudar-la, i decideix demanar l'ajuda de l'Oshino, l'home que l'altra vegada l'havia ajudat amb la seva pròpia situació. A través de diversos contes sobre dimonis i déus, Bakemonogatari segueix l'Araragi mentre mira d'ajudar els qui pateixen malalties sobrenaturals.