Cardcaptor Sakura té lloc a la fictícia ciutat japonesa de Tomoeda, a prop de Tòquio. Clear Card-hen comença on acaba la primera sèrie, amb Sakura Kinomoto començant el curs de l'institut júnior amb els seus amics, inclòs el Syaoran que acaba de tornar a Tomoeda. Després de tindre un somni profètic amb una misteriosa figura, comencen a aparèixer les Cartes Clear.