Fa molt de temps, tots els humans vivien sota el mar. No obstant això, algunes persones van preferir la superfície i van abandonar la vida sota l'aigua de manera permanent. Com a conseqüència d'això, van ser despullats de la protecció anomenada "Ena", que els permetia respirar sota l'aigua. Amb el temps, la fractura entre els habitants del mar i de la superfície es va anar ampliant, malgrat que el contacte entre tots dos pobles encara existia. "Nagi no Asukara" segueix la història de la Hikari Sakishima i la Manaka Mukaido, juntament amb les seves amigues de la infància, la Chisaki Hiradaira i la Kaname Isaki, que es veuen obligades a abandonar el mar i assistir a un institut de la superfície. Allà, el grup també coneix en Tsumugu Kihara, un company d'estudis i pescador que estima el mar. La Hikari i les vides dels seus amics es veuen obligades a canviar, ja que han de fer front a l'odi i a la discriminació entre la gent del mar i de la superfície, alhora que als canvis de les seves vides personals, i a una tempesta imminent que podria significar la mort per a tots els qui habiten a la superfície.

Fa una dècada, un tràgic naufragi va separar la Fena Houtman del seu amic de la infància, en Yukimaru, i es va prendre la vida del seu pare. Ara, amb 23 anys, està atrapada en una illa i condemnada a passar la resta de la seva vida venent-se als homes. Durant la nit en què s'ha de casar per força amb un client, la Fena trama un pla per a escapar-se dels seus amos, però dos vells coneguts intervenen inesperadament i l'ajuden a fugir. Tots tres s'afanyen cap a mar obert i desembarquen a l'illa Goblin, un lloc misteriós que és la llar d'un clan de guerrers ferotges. És allà on la Fena s'assabenta que el desafortunat viatge final del seu pare era a la recerca d'un lloc anomenat "Edèn", la ubicació d'alguna cosa important que havia de protegir. Amb res més que un cristall com a pista, la Fena s'haurà d'encarregar de trobar aquest lloc, ja que és l'única persona que ho pot fer. Mentre encara recerca el que el seu pare va deixar enrere, la Fena es retroba amb en Yukimaru, que l'anima a continuar l'aventura. Ara capitana d'una tripulació de set persones, la Fena haurà de navegar per alta mar a la recerca de l'Edèn. Però a mesura que grups estranys comencen a atacar-la, el perillós viatge resulta ser encara més difícil del que semblava anteriorment.

Després d'un conflicte militar devastador, els països fan la guerra a l'ombra. Un espia inusual, en Klaus, no ha fracassat mai en la feina malgrat les seves peculiaritats, i està reunint un equip per a dur a terme una missió impossible... amb més del 90% de probabilitat de fracàs. No obstant això, els membres que ha elegit són tots fracassats sense experiència. Hauran d'utilitzar tots els trucs que coneguin (i fins i tot els que no) per a demostrar que estan a l'alçada!

Després d'un últim torneig i una derrota vergonyosa a la ronda final, la Michi decideix deixar el judo. Entre les activitats socials de l'institut i els exàmens d'accés, no tindrà temps de competir en l'art marcial que més li agrada, però deixar de banda les velles aficions és una part essencial de fer-se gran. Tot i això, el seu amor pel judo perdura, i torna amb força quan coneix la seva nova companya de classe, la Towa, la noia que la va vèncer en el seu últim enfrontament! La Towa vol formar un club de judo a l'institut, però necessitarà nous membres per a posar-lo en marxa. Unides per l'amor pel judo, llançaran la passió al ring totes dues juntes i tornaran a fer un ippon!