En Takashi Natsume s’ha acostumat a les seves trobades amb els youkai a través del Llibre d’Amics, que conté els noms dels youkai que la seva àvia, la Reiko Natsume, va segellar en contractes. Aquestes trobades permeten a en Natsume entendre millor els youkais, en Reiko i a ell mateix. El Llibre d’Amics és una potent eina que es pot utilitzar per a controlar els youkais; és cercat tant per youkais com per exorcistes. En Natsume només vol viure la seva vida quotidiana en pau, però es veu constantment pertorbat per aquestes experiències. Si vol posar fi a aquest turment, en Natsume haurà d’explorar més coses sobre el llibre i el món de l’exorcisme, així com començar a obrir el cor a aquells que el puguin ajudar.