En un futur no gaire llunyà, els humans entren en guerra amb uns éssers extraterrestres anomenats WORM. Després d'aconseguir guanyar aquesta guerra fent ús d'armes de destrucció massiva, la població humana acaba fortament reduïda, i resten pocs homes joves per a unir-se a l'exèrcit. Això provoca que, una vegada els WORM tornen a aparèixer, es creï una unitat de robots gegants anomenada Sonic Divers, pilotada per tres noies joves. Aconseguiran vèncer l'enemic altre cop?